林业科学研究

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新疆额尔齐斯河流域苦杨与欧洲黑杨遗传多样性分析

郑书星, 张建国, 何彩云, 保尔江, 段爱国, 曾艳飞, 赛力克

2014, 27(3): 295-301.

关键词: 苦杨, 欧洲黑杨, 遗传多样性, 遗传分化

[摘要]() [引证文献] ()

应用SSR标记技术，对新疆额尔齐斯河流域河谷分布的苦杨（Populus laurifoli）和欧洲黑杨（Populus nigra）天然居群的遗传多样性和遗传分化进行了研究。结果显示：苦杨和欧洲黑杨的天然居群具有较高的遗传多样性，且苦杨明显高于欧洲黑杨。与苦杨居群相比，欧洲黑杨居群间基因流较高，居群间的遗传分化程度较小，变异主要源于居群内。苦杨和欧洲黑杨居群内的杂合度较高，各个居群的各项遗传参数都要小于物种水平。苦杨和欧洲黑杨均偏离Hardy-Weinberg平衡，表现为杂合子过量的现象。

新疆额尔齐斯河流域白杨派植物居群遗传多样性分析

郑书星, 张建国, 何彩云, 保尔江, 段爱国, 曾艳飞, 刘爱民

2015, 28(2): 222-229.

关键词: 银白杨, 欧洲山杨, 克隆结构, 克隆多样性, 遗传多样性

[摘要]() [引证文献] ()

应用SSR标记技术,对新疆齐斯河流域河谷分布的白杨派树种银白杨、银灰杨和欧洲山杨天然居群的克隆结构、克隆多样性和遗传多样性进行研究。结果表明:欧洲山杨、银白杨和银灰杨均有很强的克隆繁殖特性。欧洲山杨、银白杨居群的克隆多样性均比较高,Simpson指数分别为0.987和0.983。与欧洲山杨相比较,银白杨居群具有较低的遗传多样性,Shannon信息指数分别为1.068 9和0.324 9,Nei多样性指数平均为0.505 6和0.211 2。欧洲山杨和银白杨居群间的遗传一致度均较高,变幅分别为0.778 1~0.954 4和0.975 1~0.994 6,反映出其超长距离的基因流特性,超强的基因流阻止了银白杨和欧洲山杨居群的遗传分化。研究发现,银白杨和欧洲山杨分别有95%和89.98%的遗传变异存在于居群内。

新疆额尔齐斯河流域杨属植物种间关系的SSR分析

殷继艳, 张建国, 何彩云, 保尔江, 段爱国, 曾艳飞, 王健

2016, 29(1): 17-24.

关键词: 额尔齐斯河, 杨属, 种间关系, SSR

[摘要]() [引证文献] ()

[目的]为探讨额河杨和银灰杨天然杂种的起源机制,[方法]应用18对SSR标记,从分子水平上对新疆额尔齐斯河流域杨属植物的种间关系进行分析研究。[结果]表明:(1)SSR系统发育树将整个流域天然杨属植物分为两大类群,即黑杨派和青杨派为一类,白杨派为一类;(2)白杨派派内系统聚类图显示,银白杨、欧洲山杨、银灰杨三个树种均有较大的遗传分化,特别是杂种银灰杨似乎更大;(3)黑杨派和青杨派的UPGMA分类图显示,青杨派和黑杨派分属于2个分支,其中,青杨派内部分化相对简单,分为2支,均为典型的苦杨;黑杨派内部的分化较为复杂,可分为4类,包括典型的欧洲黑杨、额河杨和回交子代。[结论]杂种额河杨具有更多的欧洲黑杨的遗传成分,因此,将额河杨放到黑杨派是正确的。

中国沙棘和云南沙棘的遗传分化及遗传多样性

王天翼, 徐悦, 王罗云, 张建国, 曾艳飞

2021, 34(4): 13-21. doi: 10.13275/j.cnki.lykxyj.2021.04.002

关键词: 中国沙棘, 云南沙棘, SSR, 遗传分化, 遗传多样性

[摘要]() [引证文献] ()

目的探究中国沙棘和云南沙棘的遗传分化，明确二者分布区的地理边界，并评估其遗传多样性情况。方法利用18个简单重复序列（SSR）标记对32个中国沙棘和云南沙棘种群进行遗传变异检测，结合形态学和地理分布，利用系统发育分析和遗传结构分析鉴定种群分组情况，计算种群间遗传分化系数（F_ST），开展分子方差分析，计算遗传多样性参数（等位基因数（N_A）、有效等位基因数（N_E）、观测杂合度（H_O）、期望杂合度（H_E）和近交系数（F_IS））。结果中国沙棘的遗传多样性高于云南沙棘，中国沙棘种群间的遗传分化系数低于云南沙棘。AMOVA分析显示：种群间遗传变异所占比例中国沙棘（25.5%）低于云南沙棘（36.7%），表明来自不同地理种群的中国沙棘分化程度低、遗传变异更多的来源于种群内不同个体间。系统发育树分析显示：中国沙棘个体主要聚为一大支，而云南沙棘存在多个差异较大的分支，中国沙棘和四川地区的云南沙棘关系很近。遗传结构分析将所有中国沙棘和云南沙棘个体分为2组，2亚种间邻近种群存在杂交，尤其是位于四川北部的红原、松潘种群。结论中国沙棘相较于云南沙棘有更高的遗传多样性和较低的种群间分化；推测2亚种的分布边界位于四川北部的红原县、松潘县地区一带。

基于表型和SSR标记的陇南油橄榄品种鉴定与遗传多样性分析

徐悦, 黄兰, 李金花, 邓煜, 张建国, 曾艳飞

2022, 35(4): 33-43. doi: 10.13275/j.cnki.lykxyj.2022.004.004

关键词: 油橄榄, 表型多样性, 质量性状, 数量性状, 品种鉴定, 遗传多样性

[摘要]() [引证文献] ()

目的该研究对我国油橄榄主产区甘肃省陇南市现有品种进行了的准确鉴定和遗传多样性计算，为我国油橄榄种质资源引种和驯化、育种及利用提供参考。方法利用13个SSR标记对来自83个油橄榄品种的110棵单株进行品种鉴定和遗传多样性分析，并对其中属于68个品种的90棵单株进行叶片、果实和果核形态性状的测定和分析，最后开展了基于表型性状和SSR标记的单株聚类和结果比较。结果陇南油橄榄表型数量性状和质量性状多样性指数分别为1.83和0.79；SSR分析发现83个品种包括78个不同的基因型，观测杂合度和期望杂合度分别为0.683和0.754；这些基因型可分为3大组，基因型所属分组与其起源地有一定相关性；我国选育品种的基因型大多与起源意大利的品种分组更近；与基于表型的聚类树相比，基于SSR基因型的聚类树更倾向于将同一品种的不同单株聚在同一支。结论陇南共有78种不同基因型的品种，SSR标记比表型鉴定品种更具准确性，且能反映亲缘关系。该地区油橄榄表型多样性和遗传多样性较高，引种品种主要是来自地中海西部和中部国家，国内选育品种与意大利起源的品种相似；为更多样化可考虑引种或选育更多起源国的品种。

基于沙棘转录组序列开发EST-SSR分子标记

李珊珊, 曾艳飞, 何彩云, 张建国

2017, 30(1): 69-74. doi: 10.13275/j.cnki.lykxyj.2017.01.0010

关键词: 沙棘, 转录组, EST-SSR, 引物

[摘要]() [引证文献] ()

目的本研究通过对蒙古沙棘“向阳”品种的转录组序列进行SSR引物开发，为沙棘亲本分析、遗传多样性和遗传育种等研究提供支持。方法利用已测得的转录组序列进行分析和筛选，整理具有SSR位点的序列，进行引物设计，随机挑选179条引物进行验证。结果得到具有SSR位点的EST序列17 383条，其中，单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸重复基元分别占62.77%、21.82%和13.77%；二核苷酸重复基元类型以AT和AG为主，三核苷酸重复基元类型以AAG、ATC和ATA为主。9 291条序列设计出扩增EST-SSR位点的引物，随机合成的179对引物中，142对扩增成功，选取其中92个位点的扩增产物上机检测，40个SSR位点(43.48%)呈现多态。对扩增稳定且峰图清晰的17个多态位点的进一步分析, 得到蒙古沙棘天然群体在各位点的观测杂合度(H_O)为0.083~0.875，期望杂合度(H_E)为0.180~0.750。结论本研究开发出的EST-SSR标记，为后期进行沙棘属植物遗传多样性分析、遗传图谱构建及分子育种等研究提供了重要支持。

叶绿体全基因组序列确定钻天柳在杨柳科中的系统发育位置

冯楚航, 何彩云, 王莹, 曾艳飞, 张建国

2019, 32(2): 73-77. doi: 10.13275/j.cnki.lykxyj.2019.02.011

关键词: 二代测序, 柳属, 杨柳科, 叶绿体基因组, 钻天柳

[摘要]() [引证文献] ()

目的为解决濒危物种钻天柳在杨柳科中分类学位置的争议。方法本研究通过二代测序技术，从头测序、拼接得到钻天柳叶绿体基因组全序列，并与已发表的9种杨属植物和4种柳属植物的叶绿体基因组全序列进行比较，采用最大似然法、最大简约法和贝叶斯推断法分析了这些物种的系统发育关系。结果研究发现：钻天柳总基因组为155 661 bp，由长度为84 536 bp的长单拷贝（LSC）区域和16 215 bp的短单拷贝（SSC）区域，以及一对分隔开它们的27 455 bp的反向重复序列（IRS）组成。钻天柳叶绿体基因组总GC含量为36.68%，共有113个不同的基因，包括79个蛋白质编码基因，30个tRNA基因和4个rRNA基因，其中，有20个基因分布于反向重复区；在所有基因中，有14个基因包含1个内含子，3个基因（rps12、clpP、ycf3）内含有2个内含子；系统发育分析以100%的支持率将钻天柳与柳属黄花柳亚属的2个物种聚为一支，杨属的所有物种聚为另一支。结论本研究首次组装并注释了钻天柳叶绿体基因组全序列，并明确支持钻天柳并入柳属，而非单独成属，这将为钻天柳甚至杨柳科的系统进化研究提供重要参考。

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